生物發(fā)酵罐發(fā)酵初期一旦發(fā)現(xiàn)種子受到雜菌污染，那么該種子就不能再接入罐體中進(jìn)行發(fā)酵，應(yīng)經(jīng)滅菌后棄之，并對(duì)種子罐內(nèi)、管道等進(jìn)行仔細(xì)檢查和*滅菌。然后，要采用備用種子，選擇生長(zhǎng)生產(chǎn)無(wú)染菌的種子接入發(fā)酵罐，繼續(xù)進(jìn)行發(fā)酵生產(chǎn)。如無(wú)備用種子，則可選擇一個(gè)適當(dāng)菌齡的發(fā)酵罐內(nèi)的發(fā)酵液作為種子，進(jìn)行"倒種"處理，接入新鮮的培養(yǎng)基中進(jìn)行發(fā)酵，從而保證發(fā)酵生產(chǎn)的正常進(jìn)行。
當(dāng)生物發(fā)酵罐在發(fā)酵前期發(fā)生染菌后，如培養(yǎng)基中的碳、氮源含量還比較高時(shí)，終止發(fā)酵，將培養(yǎng)基加熱至規(guī)定溫度，重新進(jìn)行滅菌處理后，再接入種子進(jìn)行發(fā)酵；如果此時(shí)染菌已造成較大的危害，培養(yǎng)基中的碳、氮源的消耗量已比較多，則可放掉部分料液，補(bǔ)充新鮮的培養(yǎng)基，重新進(jìn)行滅菌處理后，再接種進(jìn)行發(fā)酵。也可采取降溫培養(yǎng)、調(diào)節(jié)pH值、調(diào)整補(bǔ)料量、補(bǔ)加培養(yǎng)基等措施進(jìn)行處理。
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